為避免泛政治性爭議，兩岸直航船只將僅限於兩岸“國兩岸物流籍”船舶，排除外籍船舶。但兩岸航商擁有、懸掛他國國旗的權宜船則有條件開放。當前尚未完全達成共識，下周二進行最後協商才能敲定。船只掛旗方式則比照小三通模式，船尾不懸掛船舶所屬國家國旗；入港時，旗杆不升起入港國國旗。  台灣正利海運周家獻指出，若大陸能先開放上述10個港口，初步可滿足兩岸航運界的貨運量需求。航運大約需要4至5個月的船只安排、攬貨等作業時程，大約明年農歷年後，兩岸海運直航船班可正式開航。  陽明海運盧峰海表示，兩岸直航市場限制兩岸“國籍”船舶航行，台籍航商是否將當前權宜船改回“國籍”船舶，仍需視相關配套而定，例如船員限制規範、稅負等。  “國籍船”載貨量不斷萎縮因兩岸遲遲未開放直航，台籍航商為經營大陸航運市場，紛紛改掛權宜船。台交通部統計，1994年台灣推動亞太轉運中心時，台灣“國籍船”超過1000萬“載重噸”  氬焊機,pos,pos系統,
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